La sauvegarde d'un fichier ONIX à l'aide d'ONIXEDIT s'effectue de façon standard à l'aide des fonctions Enregistrer et Enregistrer sous du menu Fichier. Le fichier qui sera alors enregistré sur votre ordinateur sera un fichier ONIX valide au format ONIXEDIT (voir Les formats spécialisés). Bien que ce fichier puisse être acheminé directement à vos partenaires commerciaux, il est préférable de ne leur faire parvenir que des fichiers au format attendu par ces derniers. En effet, le format ONIXEDIT contient la totalité des éléments d'informations de l'ensemble des formats spécialisés supportés par ONIXEDIT. Il existe donc une fonction permettant d'exporter un fichier (en tout ou en partie) dans un format spécialisé particulier. Voir la section Sauvegarder un fichier dans un format spécialisé pour plus d'informations.